做过一些简单的应用，觉得一般有下面一些设计方法：
1、开始的时候，只在EDK上做开发，直接下载到FPGA芯片。最终程序可以通过生成mcs文件下载到PROM中。
2、很多情况下，一个FPGA扳子上只有处理器来利用FPGA资源是不合理的，还要增加其它功能，这时，需要把处理器硬件作为子模块，由EDK下生成的硬件网表之类的信息导出，然后在ISE下增加自己的代码，并生成bit文件和bmm文件，然后把bit文件和bmm文件导入到EDK环境，这些可以说是硬件部分吧。
然后就是做软件部分，由MSS文件作为输入产生库和BSP，在此基础上编程，并编译生成elf文件，通过EDK下的工具把elf文件和前面所说的文件合起来生成最终的download.bit文件。
3、根据经验来自己修改MHS文件和MSS文件生成硬件系统和软件系统，方便于经常改动的系统。
4、处理器可能要处理很多外部设备，但是系统提供的无非是串口，简单的存储器，看门狗定时器等等一些功能。这就需要我们制作挂在OPB总线上的设备接口。这方面要了解总线接口，了解新的外设需要实现的功能，EDK自动生成的部分代码是VHDL语言编写的，一般建议自己做这方面接口也用VHDL语言。做完硬件接口，也需要根据你配置的硬件接口写软件驱动。
这方面我也做的不多，但遇到有几个高人搞过。
5、还有双核、嵌入各种操作系统啦等等，几乎没搞过。
自己学习EDK也快1年了，一直没什么长进，上面说的也说不上来专业词语，很是抱歉。
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