近日,专用计算芯片研发与算力解决方案创新企业雪湖科技在全球超过55家参赛企业中脱颖而出,凭借“面向新药研发的生命科学计算专用超算Yaddle”荣获由赛灵思举办的“全球自适应计算挑战赛(Adaptive Computing Challenge 2020)”亚军,这也是中国区及生命科学领域的唯一获奖企业。“Yaddle”由雪湖科技自主设计开发,赋能下一代基于动态的药物设计(motion-based drug design)。

 

雪湖科技获“全球自适应计算挑战赛”亚军


传统新药研发主要基于蛋白质的三维结构,这一过程类似于“看照片”,仅能根据生物分子的静态结构猜测药物与靶点的结合,成功率低。近年来,基于蛋白质四维动力学的药物设计方法为新药研发提供了更多可能性。通过“看视频”,研发人员能清晰观察并深入了解生物分子的动态变化,发现药物与生物分子之间的作用路径。分子动力学模拟将成为下一代新药研发的必备工具。


从“看照片”到“看视频”,大规模分子动力学计算对算力提出了巨大挑战。凭借在专用计算芯片领域深厚的积累,雪湖科技基于赛灵思强大的FPGA芯片,打造了“生命科学专用超算Yaddle”,助力药物设计迈入“看视频”的时代,缩短新药研发周期,降低新药研发风险,进一步提升药物发现的效率。“Yaddle”同时兼容常用分子动力学软件,助力新药研发从基于结构的药物设计(structure-based drug design)升级到下一代基于动态的药物设计(motion-based drug design)。

 

“面向新药研发的生命科学计算专用超算Yaddle”系统架构


雪湖科技生命科学计算首席科学家盛楠博士表示:“目前,所有药物的靶向蛋白质在基因上占比仅5%,仍有大量疾病相关蛋白质没有靶向药物,甚至有很多疾病的致病机理尚不清晰。随着新药研发步入‘算力时代’,雪湖科技计划在年内实现‘Yaddle’的正式商用,并欢迎新药研发领域企业携手合作,利用下一代基于动态的药物设计(motion-based drug design)加速新药研发过程,为患者的生命健康带去福音。”


“全球自适应计算挑战赛2020”由赛灵思举办,赛事从2020年夏季启动,吸引了全球顶尖FPGA开发者与创新企业参加,比拼如何借助赛灵思硬件平台以创新技术解决现实问题。